ตามที่ สกอ.ได้จัดทำ “โครงการนำเกณฑ์คุณภาพการศึกษาเพื่อการดำเนินการที่เป็นเลิศมาใช้ในการประกันคุณภาพการศึกษาภายใน” ขึ้น โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อสนับสนุนให้สถาบันอุดมศึกษาหรือคณะวิชาที่มีความพร้อมและมุ่งมั่นในการพัฒนาคุณภาพไปสู่ความเป็นเลิศ สามารถนำเกณฑ์คุณภาพการศึกษาเพื่อการดำเนินการที่เป็นเลิศมาใช้ในการประกันคุณภาพการศึกษาภายใน เพื่อการพัฒนาคุณภาพการจัดการศึกษาไปสู่ความเป็นเลิศอย่างก้าวกระโดด โดยได้มีกระบวนการพิจารณาคัดเลือกต่างๆ ตามที่กำหนดไว้ในแผนกิจกรรมของโครงการนั้น ได้มีหน่วยงานที่ผ่านการพิจารณาคัดเลือก ในแต่ละปีการศึกษา ดังนี้
ครั้งที่ 1 พ.ศ.2556 (ปีการศึกษา 2555)
- คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- คณะแพทยศาสตร์ โรงพยาบารามาธิบดี มหาวิทยาลัยมหิดล
- คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
ครั้งที่ 2 พ.ศ.2557 (ปีการศึกษา 2556)
- คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะอุตสาหกรรมเกษตร มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
ครั้งที่ 3 พ.ศ.2558 (ปีการศึกษา 2557)
- คณะเศรษฐศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- คณะพยาบาลศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
ครั้งที่ 4 พ.ศ.2559 (ปีการศึกษา 2558)
- มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ระดับสถาบัน
- คณะเทคนิคการแพทย์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- คณะพยาบาลศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะทันตแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
ครั้งที่ 5 พ.ศ.2560 (ปีการศึกษา 2559)
- คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร
- คณะบริหารธุรกิจและการบัญชี มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะแพทยศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
- คณะพยาบาลศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
- คณะศิลปศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
- คณะเทคนิคการแพทย์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- คณะสัตวแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- วิทยาลัยศิลปะ สื่อ และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- คณะสาธารณสุขศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะศิลปกรรมศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยศิลปากร
- คณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
- คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
- คณะทรัพยากรธรรมชาติ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
- คณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี
- คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยบูรพา
- ครั้งที่ 7 พ.ศ.2562 (ปีการศึกษา 2561)
- คณะศึกษาศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะวิศวกรรมศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น
- คณะพยาบาลศาสตร์ มหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์
- คณะเกษตรศาสตร์ มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี
- คณะทันตแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
- ระดับสถาบัน มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี
- คณะทันตแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
- คณะเทคโนโลยีและสิ่งแวดล้อม มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
- คณะวิศวกรรมศาสตร์ มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์